Bakteri endofit merupakan bakteri yang hidup di dalam jaringan tanaman yang bersifat menguntungkan bagi tanaman. Kelor (Moringa oleifera Lam.) dimanfaatkan sebagai imunodulator, gangguan pencernaan, simpatolitik, spasmolitik, antivirus, hiperkolesterolemia, antiinfeksi, dan antibakteri. Senyawa aktif antibakteri yang terdapat pada ranting dan daun kelor yaitu alkaloid, saponin, dan flavonoid. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi bakteri endofit ranting dan daun kelor serta mengetahui aktivitas antibakteri metabolitnya terhadap Staphylococcus aureus dan Escherichia coli. Isolasi bakteri endofit ranting dan daun kelor menggunakan tehnik penanaman langsung pada medium nutrient agar. Metode yang digunakan untuk uji aktivitas antibakteri menggunakan metode difusi agar. Hasil isolasi bakteri endofit pohon kelor diperoleh 2 isolat dari daun dan 2 isolat dari ranting yang mampu menghasilkan senyawa aktif dengan isolat DKS1 menunjukkan aktivitas antibakteri tertinggi terhadap S. aureus dan E. coli dengan potensi relatif ekstrak metabolit bakteri endofit isolat DKS1 terhadap S. aureus 2,23 x 10 -3 kali kloramfenikol dan E. coli 2,85 x 10 -3 kali kloramfenikol.